發酵中藥飼料品質的好壞直接影響畜禽產品的產出，由于飼料原料供應緊張、霉菌毒素污染等問題的存在，劣質飼料及原料難免流入市場，對養殖業造成不同程度的損害。發酵中藥有預防和疾病、中和毒素、提高飼料利用率、提高動物性能等作用，在一定程度上可以提高飼料品質，緩解劣質飼料對畜禽造成的性能降低。

　　發酵中藥飼料品質較好的情況下，飼料的利用率較高，能夠為動物提供充足的營養，發酵中藥制劑在提高飼料利用率方面的作用不明顯;但同時，由于動物體能夠攝取的營養，生理機能相對正常，對疾病、應激的抵抗力較強，制劑在發揮目標作用(如提高產蛋率、產奶量等)的同時，通過進一步加強機體免疫能力、維持腸道的正常功能狀態，能夠減少或避免疾病的發生，進而提高畜禽的性能，降低投入。

　　例如，在飼料品質較差的情況下，發酵中藥(增蛋散)能夠降低蛋雞采食量(5-10%)，并明顯提高產蛋率和蛋品質，緩解或避免各種應激造成的減料和產蛋率下降問題;母豬、仔豬飼料品質較好，但仔豬腹瀉仍是目前養豬業一大難題，發酵中藥(發酵型生乳散、復合多糖、芪貞顆粒)能夠解決母豬便秘、初生和斷奶仔豬腹瀉的問題，減少因腹瀉造成的仔豬高病死率、高淘汰率和僵豬的問題。總體來看，飼料品質是影響動物的關鍵因素，其對發酵中藥臨床作用效果的具體表現形式，也有著重要的影響。